Muchas dudas en nueva plantación de viñas para vino

Atención, pregunta: Estoy proyectando una nueva parra-pérgola en el jardín de casa. Al excavar los agujeros para ir removiendo tierra me encuentro con las raíces podridas y malolientes de una especie de palmera rara que talé hace un par de años. La raíz es de estípite (no es madera) y se hunde profundamente en el subsuelo. Es como si fuese un tronco, nada de raicillas. No quiero que me dé problemas de nematodos o de otros bichos, hongos, virus, etc.

Trataré de destoconar con la azada todo lo que pueda pero... Sabéis de algún remedio preventivo que funcione para echarle antes de plantar una cepa en ese sitio?